Wasserkontinent
Der Wasserkontinent besitzt zwei größe Städte: Ruhenau und Trubelstadt. Während man in Ruhenau den Start der Reise antritt, befindet sich in Trubelstadt das Hauptquartier des Forscherteams.
Der Wasserkontinent ist der erste Kontinent, den man in Pokémon Super Mystery Dungeon betreten kann und kann daher von Anfang an erkundet werden. Auf ihm befinden sich 35 verschiedene Dungeons und als einziges zwei Städte.
Ruhenau
Ruhenau verfügt über folgende Läden:
Dungeons
Auf dem Wasserkontinent gibt es folgende Dungeons, die man erkunden kann: